Parallel est l'histoire d’un jeune garçon, Nekota, et d’une jeune fille, Hoshino, qui se vouent l’un pour l’autre une véritable haine. Pourtant lorsque le père de Nekota décide de se marier avec la mère de Hoshino, les deux rivales devront par conséquent cohabiter ensemble, et ce dans le plus grand secret de leurs amis et camarades de classe.